Heute ist mein letzter Tag hier an der TU Graz, in ein paar Stunden werde ich schon wieder am Weg nach Linz sein und ab Montag dann in München zum Studieren...

Alles in allem war die Summerschool sicher eine sehr interessante Zeit. Besonders das Einarbeiten in ein bestehendes, riesiges Programmierprojekt war eine komplett neue Erfahrung, aber auch der Umgang mit Java-Server-Pages und Frameworks wie Struts. Mein (kleiner) Anteil am Programm ist ja schon fertig, heute wird das ganze noch in die "richtige" Website eingebaut...

Ein paar kleine Änderungen am Programm habe ich heute noch durchgeführt, vor allem am Layout, aber auch noch andere Kleinigkeiten. Die Programm-Erweiterung von mir ist jetzt im Prinzip fertig und wird, sobald es am großen Server getestet wurde, online gehen.



Die MARS ist im Normalfall unter folgendere Adresse erreichbar
https://mars.genome.tugraz.at/marsWEB/
Um allerdings auf die Daten zugreifen zu können, braucht man einen Zugang des Instituts für die MARS, den man leider im Normalfall nicht haben wird. Öffentlich sind nur sehr wenige Bereiche, trotzdem kann man sie sich ja mal anschauen.

Das Programm, an dem ich in letzter Zeit geschrieben habe ist nun fast fertig. Die meisten dem MIAME-Standard nicht entsprechenden Einträge werden erkannt, die Übersicht funktioniert...



Ein paar Änderungen am Design werde ich vielleicht vornehmen, auch ein spezieller MIAME-Error-Typ muss noch eingebaut werden und dann alles auf den Institutsserver aufgespielt werden...

Alles in allem ist die Summerschool für mich also beinahe vorbei, nächste Woche werden noch ein paar kleine Änderungen anstehen, dann bin ich fertig.

Um es kurz zu fassen: Viel hat sich heute nicht getan, nur ich hatte was zu tun. Neben ein "paar" Änderungen in der Gesamtstruktur des Programms, die wieder haufenweise Fehler erzeugten, die man dann mühsam aus der Konsole raussuchen muss, ...



... habe ich nur ein paar weiter "Error-Typen" hinzugefügt, die jetzt beim MIAME-Compliance-Check überprüft werden. Das ganze funktioniert gut und wie gestern geschrieben ist das Hinzufügen weiterer "Error-Typen" recht einfach. Sobald ich dann morgen oder am Montag alle (notwendigen) Error-Typen implementiert habe, bin ich fertig. Muss nicht aber vielleicht das Web-Design noch etwas angepasst werden?

Momentan ist mein Programm in der Lage, erst eine Art der Verletzung des MIAME Standards ausfindig zu machen. Das ist zwar noch recht wenig, aber die neuen "Error-Typen" werden sich jetzt schnell einbinden lassen. Ein eigens entwickelter Collector ist ab sofort dafür zuständig, die MIAME-Errors zu verwalten und entsprechend ihres Typs zu sortieren. Dieser kümmert sich dann auch um die Ausgabe getrennt nach Typ (oder auch alle auf einmal).

Er speichert in einer HashMap (~Tabelle) auf der einen Seite den "Error-Typ", auf der anderen eine Collection, die die einzelnen Fehler enthält. Das ganze funktioniert mittlerweile ganz gut, sodass bereits eine provisorische Fehlerübersicht möglich ist.