Jetzt versuchen wir die Konzentrationsfunktion im Programm zu erstellen bzw. so aendern, das es auch funktioniert =).
Etwas schade ist, dass unser zweiter Betreuer Ivo jetzt im Urlaub ist, er wusste auf jede Frage die Antwort und kennt sich bei Linux, Perl, ... einfach voll aus.
Unser Betreuer Andreas kennt sich eher auf anderen Gebieten aus, aber er kann die noch einfacheren Aufgaben von uns auch betreuen...
Mal schauen, ob wir die Fehler beseitigen koennen, waere froh, wenn wir das Programm komplett fertig haetten, wenn wir wieder
wieder gehen.
Cu Daniel

Unser RNAcofold Programm ist fertig und funktioniert sogar!
Und das obwohl wir eigentlich mit der doppelten Zeit gerechnet haben oder noch mehr...
Jetzt machen wir noch ein paar Feineinstellungen z.B. das Optische und noch zusaetzliche Funktioenen, die das normale, bereitsbestehende RNAfold Programm nicht bietet.

Heute (bis jetzt) und was passiert ist:
Wir beide haben uns mal im institut umgeschaut, alle begruesst und erkundigt wer was macht.
Dann haben sich unsere beiden Betreuer unterhalten, was wir machen koennten...
Jetzt werden wir ab morgen anfangen das Web angebot von dem Institut zu erweitern:
Derzeit ist nur ein Teil des ViennaRNA Programms online
(http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi) wo man eine Sequenz falten, die kleinste freie Energie ausrechnen und zeichnen lassen kann.
Wir sollen jetzt probieren einen weiteren Teil des Programms (RNAcofold) so hochzuladen, dass gleich wie bei dem RNAfold nur noch die Sequenzen eingegeben werden muessen und den Rest das Programm macht.
Dazu haben wir vorher alle Teilprogramme vom ViennaRNA ausprobiert und getestet....

Am ersten Tag wurde uns das Institut gezeigt und wir lernten etwas Theorie ueber die RNA (also Sekundaerstruktur, Sequenzen, mRNA, tRNA, ...).
Unsere Betreuer sind eigentlich Andreas Svrcek-Seiler und Ivo Hoffacker, aber alle Forscher des Institutes sind nett und geben auf jede Frage eine Antwort und helfen uns gerne weiter...
Ich arbeite mit einem anderen Summerschool-Teilnehmer zusammen: Oliver Skocek.
Wir koennen uns eigentlich unsere Arbeitszeit frei aussuchen, also von ca. 10 uhr (nicht frueher!) bis ca. 16-17 uhr.
Innerhalb der ersten Tage lernten wir noch mit dem Computerprogramm ViennaRNA-1.6.1 umzugehen und Sachen auszurechnen.
So z.B. eine RNA-Sequenz falten und dabei die minimalste freie Energie berechnen.
Mal schauen, was wir heute lernen und anwenden...

Ich bin der Daniel aus Vorarlberg und gehe dort in die HTL Dornbirn in die Richtung Chemie Ingenieurwesen.
Ich mag die praktische Arbeit im Labor besonders, und freue mich schon auf die vor mir liegenden 4 Wochen (3. Juli - 28.Juli).
Ich werde an dem Institut für Theoretische Chemie in Wien (1090) mein Praktikum machen.
Die Homepage ist: http://www.itc.univie.ac.at/index.html
und ein Bild von meinem Betreuer Andreas Svrcek-Seiler ist unter http://www.itc.univie.ac.at/telephon.html
Freu mich so viele andere SummerSchüler kennenzulernen...