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Dominik Kiesenhofer
Letztes Update: 17:28 / 26.08.2008

Mein Praktikum findet in Wien im IMBA (Institut für molekulare Biotechnologie) statt. Jedoch gehört die Forschungsgruppe, in der ich im August mitarbeiten darf den Max F. Perutz Laboratories an, welche eine Joint Venture der Uni Wien und der Medizinischen Uni in Wien sind. Das CIBIV (Center for Integrative Bioinformatics Vienna) arbeitet dabei hauptsächlich an der Erstellung von phylogenetischen Stammbäumen anhand der RNA-Struktur.

Montag, 4. August 2008

  erster Tag - Schock

Der erste Tag ist vorbei und ich bekam bereits sehr viel vor meine interessierten Augen. Vorwiegend werden im CIBIV Daten am Rechner verarbeitet. Die Arbeitsweise in silico ist für mich zwar ziemlich neu, doch ich versuche möglichst viel und möglichst schnell zu lernen. Heute wurden von sehr abstrakten Basensequenzen Sekundärstrukturen erstellt, die man auf mehrere Arten darzustellen vermag (bracket notation, Polygonstruktur, circle plot, dot plot,...) bzw. wurden auch von mehreren Sequenzen auf einmal die Consensus-Struktur erschaffen, wobei die minimumfreie Energie eine entscheidende Rolle spielt.
Außerdem erfolgt auch ein Teil der Arbeit im Labor, welches ich aber erst nächste Woche genauer zu Gesicht bekommen werde

Zu unserer Überraschung kam das für morgen zu erwartende gotv-Filmteam schon heute und wir konnten nach eine kurzen Einführung in die Arbeitsweise auch schon die ersten Interviews geben und mit einigen Fachbegriffen um uns werfen.

Zum Ausklang des ersten Tages kamen wir in den Genuss eines Vortrages eines Referenten des CIBIV, der vor versammelter Gruppe über Split Diversity referierte.

Theoretisch behandelte Themen:
Was ist Bioinformatik?
Basen der DNA und RNA
die 3 zellullären Hauptdomänen: Archaea, Eubacteria, Eucaryota

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