Heute war ich am TZT in Tulln und habe mit meiner Betreuerin an einer DNA Klonierung gearbeitet. Die ersten Schritte waren schon erledigt, meine Arbeit bestand darin, Restriktionsenzyme zu den isolierten Plasmiden zuzugeben. In die Plasmide wurde Fremd DNA aus Lactobazillen eingeschleust. Bakterien in die die Plasmide eingebracht wurden, haben diese DNA dann vermehrt. Das Plasmid wurde aus den Bakterien isoliert und nun sollen die Restriktionsenzyme die gewünschten DNA Fragmente wieder aus dem Plasmid herausschneiden.

Paralell dazu habe ich mit DNA von Lactobazillen, die mit Restriktionsenzymen versetzt wurde, ein Agarose Gel gemacht. Das Bild hat deutlich gezeigt, dass das Genom noch nicht ganz verdaut ist und noch große Fragmente existieren, da eine deutliche Bande zu sehen war. Eigentlich sollte das Genom schon in viele kleine Stücke zerschnitten sein und auf dem Foto nur noch ein verwischter Schleier zu sehen sein. Wir haben zu den Proben noch einen mykroliter Restriktionsenzym zugefügt, morgen werden wir wieder ein Gel gießen.

Seit dieser Woche arbeite ich bei einer anderen Arbeitsgruppe mit, die für den Futtermittel hersteller Biomin arbeitet. Im Rahmen des Projekts "ProPig" werden Bakterienstämme gesucht, die eine probiotische Wirkung haben, d.h. krankheitserregende ´Mirkroorganismen im Wachstum hemmen und das Immunsystem aktivieren. Das Ziel ist, weniger Antibiotika an Tiere verfüttern zu müssen, es wird sozusagen ein "Actimel für Tiere" gesucht.
Das Projekt ist eigentlich schon abgeschlossen, mit den Bakterienkulturen wird aber im Nachfolgeprojekt weitergearbeitet. Am Montag habe ich Nährlösungen mit Bakterienzellen auf Agerplatten ausgestrichen und die dann im Brutraum für einen Tag "wachsen" lassen. Am nächsten Tag haben wir aus den Petrischalen eine Einzelkolonie entnommen und damit Nährlösungen angeimpft. Aus ihnen soll dann eine Reinkultur gezüchtet werden um sicherzugehen, dass die Bakterienstämme nicht durch andere verunreinigt sind.

Nach 2 Tagen im Analytikzentrum, bin ich in die Biotechnologie gewechselt. Dort gefällt es mir auch gleich viel besser - obwohl ich praktisch keine Erfahrung habe darf ich die Experimente fast alleine durchführen. Um mir auch ein wenig theoretisches Wissen anzueignen, haben mir meine Betreuer auch alles ganz genau erklärt und mir Artikel aus Lehrbüchern kopiert.

Mit einem DNA Isolier Kit habe ich am ersten Tag eine DNA Isolierung von Biogas Proben durchgeführt. Das Ziel der Versuchsreihe ist es, festzustellen, ob sich durch bestimmte Bedingungen die Mikroorgansismen Zusammensetzung in der Biogas Anlage geändert hat.
Am nächsten Tag habe ich mit den DNAProben eine PCR zur Vervielfältung der gewünschten DNA Stücke gemacht.