Nachdem ich einige Skripte geschrieben habe, um Daten für das Pichiae Modell zu bearbeiten, zusammenzuführen oder zu generieren, mussten wir am Ende meines Praktikums leider feststellen, dass im Modell noch 38% der Gene als essentiell gelten. Dies trifft in der Natur auf Pichiae jedoch nicht zu, woraus man schliessen kann, dass noch einige chemischen Reaktionen im Modell fehlen bzw. noch nicht erforscht sind. Im Modell werden möglichst alle metabolischen pathways einer Hefezelle simuliert um dann, basierend auf linear programming, die Wachstumsrate der Zellen in verschiedenen Medien zu berechnen. Ich habe zur besseren Vorstellung eine bildliche Darstellung des Modells hochgeladen. -> Bilder :-)
...schaut ein bisschen so aus wie ein U-Bahn plan mit 3000 Stationen oder?

...zur Suche nach dem Metaboliten für ein Optimales Medium für Pichiae geschrieben.

Gestern und heute hat mir mein Betreuer die Programmiersprache Perl beigebracht.
Dazu habe ich einige kleine Skripte für verschiedene Aufgaben geschrieben.

...habe ich Reaktionen bestimmter Gene aus der Kegg Database in einer Excel Tabelle zu den katalysierenden Enzymen zugeordnet.
Mittwoch hatte ich frei.

Meine erste Aufgabe: "packe den neuen Mac aus und steck ihn an, anschliessend installieren wir noch das neue Betriebssystem." :-)
Danach bekam ich eine Introduction to linear programming
Anschliessend stand die eher eintoenige gene annotation with Kegg database an.

Austrian Centre of Industrial Biotechnology
...so heißt mein neuer Arbeitgeber bei dem ich im August mein Summerschool Praktikum absolvieren werde. Ich bin 17 Jahre alt und ich freue mich schon sehr auf neue Eindrücke aus der Welt der Biotechnologie.
Mein Betreuer Jürgen Zanghellini ist sehr freundlich und wir sind seit dem ersten Vorstellungsgespräch "per Du". Er wird mir eine "kleinere Problemstellung" für das Praktikum zur Aufgabe geben, bei welcher auch einige mathematische Elemente vorkommen werden. Konkreteres werde ich am ersten Tag erfahren.
Bis dahin wünsche ich allen Juli-Praktikanten viel Erfolg während ich es mir im Urlaub gut gehen lassen werde :-)