Today we had an easy, but long day. We did the Maxiprep which is an easy way for isolating DNA from bacteria, but you often have to waite a long time between the different steps, so we three were very tired after that day...

Der heutige Tag hat mit dem Isolieren von RNA begonnen, wobei wir wieder mal einiges selbst machen durften. Diese Arbeit war viel von sehr genauem und häufigem Pipettieren geprägt. Außerdem mussten wir immer Handschuhe und Labormantel tragen, da sich auf unserer Haut und dadurch fast überall ein Enzym befindet, welches RNA spaltet.
Am Nachmittag haben wir zum Teil die Proteine von gestern vollständig ausgewertet, zum anderen Teil haben wir eine Maxipräp (Plasmidpräpation) gemacht, um dann eine größere Menge bestimmter DNA aus Bakterien zu bekommen.

Heute haben wir uns viel in der Zellkultur (Labor) aufgehalten und verschiedenes über Zellkulturen und ihre Pflege erfahren.
Wir haben wir ein Comet Assay gemacht, was sehr langwierig und anstrengend war. Ein Comet Assay wird gemacht, um die Beschädigung einer DNA festzustellen. Zwischendurch haben wir die Auswertung der Proteine vom Freitag vorbereitet und zum Teil durchgeführt (Western blot).
Alles in allem war der Tag ziemlich anstrengend aber nicht weniger interessant.

Heute war in der Früh erst mal ein lab meeting für eine Stunde. Danach haben wir Proben vorbereitet, was relativ zeitaufwändig war. Leider konnten wir sie nicht gleich unter dem Mikroskop anschauen, da sie erst trocknen müssen... Also haben wir bei den Proteinen weitergearbeitet.Um die Proteine aus der DNA zu isolieren muss man diese auseinanderscheiden. Dafür haben wir sie in einen "Sonicater" gegeben, der mit einer bestimmten Wellenlänge des Schalles die DNA schneidet. Da wir die Protein jetzt in isolierter Form hatten, mussten wir in 4°C arbeiten, dass keine Enzyme sie zerstören. Also mussten wir in den 4°-Raum, was seeehr kalt war.
Um nun das 'Protein, welches wir haben wollen, zu bekommen, mussten einige "Waschungen" durchgeführt werde, aber das jetzt ganz genau zu erklären würde wieder mal zu weit führen...

Heute haben wir gleich mit einer eigenen PCR gestartet. Bei dieser ging es um das Protein beta-Aktin.Es war sehr spannend, vor allem, weil wir diesmal ganz alleine gearbeitet haben. In der Wartezeit haben wir dann ein LB medium hergestellt (eine Nährflüssigkeit für Bakterienkulturen). Die Bakterien, die momentan untersucht werden sollen ein bestimmtes Protein herstellen.
Nach ca drei Stunden konnten wir dann unsere Proben von der PCR zur Sequenzierung für die Auswertung. Dies bedeutet wiederum Wartezeit. Doch es zahlte sich aus- wir bekamen wieder schöne Ergebnisse. Außerdem waren wir in der Zeit nicht faul, sondern stellten eine PBS-Pufferlösung her.
Ich bin schon gespannt was uns morgen erwartet.

Today we had our first day in english. We did the PCR to genotye mice.The purpose of a PCR is to make a huge number of copies of a gene, which is necessary to have enough starting template for sequencing. I will not explain the whole principle because this woul last to long, I just say that it need a lot of time. While the PCR was running, we prepared the gel for the sequencnig.
When the PCR was over we did the sequencing, which was very intresting and reminded of CSI or so.
Well, tomorrow we will do the PCR and sequencing alone and I`m looking forward to this.
All in all it was a very intresting day

Heute haben wir uns mit den Fadenwürmern c.Elegance beschäftigt. Diese Würmer sind 1mm lang und sind für die Genforschung gut geeignet, da sie und ihre Genome bereits gut erforscht sind und sie eine Lebensdauer von ca 30 Tagen haben.
Wir haben zwei Gruppen von diesen Würmern untersucht: die gentechnisch veränderten und die Wildformen für den vergleich. Sie wurden anhand ihrer Altersflecken, ihrer Länge und ihrer Fressaktivität verglichen.
Es war heute schon um einiges interessanter, da wir mal bei der "richtige" Arbeit zugeschaut haben und nicht nur herumgeführt wurden.

Heute hatte ich meinen ersten Tag im Labor der BOKU in Wien. Vormittags bekam ich mit mit zwei anderen gen-au-Schülern eine theoretische Einführung in das Gebiet der Zellbiologie/Gentechnik. Nachmittags wurde uns dann das Labor gezeigt und erklärt. Die Leute waren eigentlich alle nett und haben bereitwillig unsere Fragen beantwortet.
Es war auf jeden Fall jetzt schon interessant und ich bin sehr auf morgen und auf das arbeiten dort gespannt.