Der heutige Freitag war ein ganz besonders wichtiger Tag, auf den wir eigentlich die ganze Woche hingearbeitet haben. Ich musste mir nämlich heute aus den 14 eColi-Genen von gestern eines ausgesucht, das ich mir am ehesten als ein gutes Target von gcvB vorstellen könnte.

Ich habe also zunächst einmal recherchiert, wofür die 4 bekannten Targets aus meiner Liste eigentlich zuständig sind und habe herausgefunden, dass alle vier etwas mit Aminosäurentransport oder Aminosäurensynthese zu tun haben. Danach habe ich dasselbe für die restlichen 10 Gene gemacht und mit Hilfe der Datenbank "DAVID" aus diesen 10 diejenigen herausgesucht, die etwas mit Aminosäuren zu tun haben. Darüber hinaus habe ich noch die Informationen aus dem Vortag, wie z.B. die Mutationenanzahl berücksichtigt. So konnte ich mich schließlich für eines dieser Gene entscheiden, und zwar für das Gen ilvC, das in der Synthese zweier Aminosäuren (Isoleucine und Valine) eine wichtige Rolle spielt. Ich habe dieses Gen gewählt, weil es noch dazu als Bindungsstelle thermodynamisch sehr günstig ist und eine gute Basensequenz, mit wenigen, aber funktionellen Mutationen in den drei Bakterienstämmen aufweist. Dieses Gen werden wir dann nächste Woche im Labor klonieren!! Ich freue mich schon darauf!